Logginlägg

Frisk igen!

Posted: 2020-04-24 11:53:19.180646

Äntligen är jag återhämtad efter en tuff period med andningssvårigheter och feber. Det låter kanske lite konstigt, men det som var mest irriterande var att all smak och lukt försvann, så otroligt irriterande när kaffet upplevs precis likadant som varmvatten! Jag ska försöka komma med lite uppdateringar igen med början under veckoslutet.

Som synes så har inte min modell följt verkligheten. Det kan finnas många anledningar till detta och jag kommer att testa lite olika scenarion.

Det jag också tänkt göra är plocka in värden från den SEIR-modell som Folkhälsomyndigheten gjort för Stockholm för att på ett entydigt sätt kunna jämföra min SEICR med en etablerad metod.

Vad som kommer i vilken ordning återstår att se.

//Johan

Fler IVA-platser ger stor effekt

Posted: 2020-03-31 12:53:53.546642

Regionerna har jobbat hårt, utöver det fenomenala arbetet som vårdpersonalen dagligen gör, med att utöka kapaciteten för IVA. Som jag såg i tidigare prognoser skulle begränsningen där gravt påverka utsikten för många patienter. Därför ville jag se hur stor skillnad det skulle bli för utfallet.

Jag passade även på att tunea parametrarna i SEICR-modellen för att passa bättre in mot de bekräftade fallen vi sett hittils. Den förra modellen överskattade IVA-behovet men underskattade dödligheten.

Det är också positivt att tidpunkten för när IVA-platserna inte längre räcker har flyttats frammåt.

Jag har funderat på om de bekräftade fallen med insjuknade skulle vara korrekt. Men om det är fallet är sjukdomens allvarlighet väldigt mycket högre än vad som kommuniceras. Jag väljer därför att inte justera spridningen utöver den sänkning till 25% som jag ansatte i tidigare prognoser.

Jag gjorde även en snabb studie av vad som skulle hända om imuniseringen efter tillfrisknande bara var 90%, resultatet var inte så illa som man lätt kan tro.

//Johan

Medicinering och uppföljd prognos

Posted: 2020-03-23 22:59:29.961096

Efter att ha läst om en fransk läkare som testade antiviralen hydroxychloroquine för att bekämpa SARS-CoV-II i kombination med antibiotikan Azithromycin med resultat som nästan är för bra bestämde jag mig för att se vad resultatet skulle bli om vi satte in detta som en kur i dagsläget. Resultatet gav blandade känslor i och med att det kan ha riktigt stor effekt om vi sätter in det på bred front snabbt, men väntan medför att effekten minskas dramatiskt. Dock vet vi ju inte i dagsläget om det faktiskt fungerar, så siffrorna är rent hypotetiska utifrån att det faktiskt fungerar som beskrivet.

Jag följde också upp min förra prognos med inläggning av bekräftade fall till och med 2020-03-22. Den spontana tanken är att det stämmer spöklikt bra. Både de inskrivna för intensivvård och dödsfallen stämmer väl överens med de förutsedda värdena. Att de bekräftade sjuka inte stämmer har förmodligen flera anledningar, en inte oviktig är det faktum att testningen har förändrats markant under tiden.

Detta går att läsa om här.

Idag presenterade folkhälsomyndigheten en vad de kallade prognos. Jag såg siffrorna när de presenterades och fick inte riktigt ihop hur de hade räknats. Men efter att ha läst "vanliga frågor" i rapporten trillade poletten ner. Se bild.

De har alltså anpassat kurvorna för att precis passa mot antalet IVA-platser i varje region. Jag hoppas och tror att de inte tror allt för mycket på siffror som tagits fram på detta sätt.

Sen är det kanske värt att notera förekomsten av "vanliga frågor" i en precis släppt rapport.

//Johan

Jag hade fel!

Posted: 2020-03-17 12:41:40.309075

Jag har ända från början sagt "jag önskar att detta inte stämmer". Det verkar nu som att jag hade rätt i det påståeendet, men dessvärre åt FEL håll! Dödstalen överstiger beräkningarna med mer än vad jag känner mig bekväm med..

Frågan jag ställer mig nu är vad som inte stämmer. Följer dödsfallsutvecklingen kurvan, bara det att jag är några dagar fel? Att flytta starten på kurvorna skulle göra att både dödsfall och bekräftat smittade ligger bättre längs prognosen. Alternativet skulle vara att vi så grovt har underskattat hur dödligt SARS-CoV-II kan bli i Sverige.

Vid en första anblick låter scenariot att jag är fem dagar fel som det trevligare av de två. Även om det är sant vill jag då poängtera att vi i så fall har missat fönstret. Åtgärder som för en vecka sedan skulle kunna ha bromsat spridningen är inte längre effektiva, även om vi vidtar strikta regler för utgång så kommer vi ändå slå i taket på antalet intensivvårdsplatser i maj.

Det andra alternativet, att dödligheten skulle vara mycket högre än vad jag har räknat på, skulle ge ytterligare 5000 döda fram till mitten av sommaren. Men! Här har vi fortfarande ett kort fönster på oss att begränsa spridningen! Så även om det är tragiskt med potentiellt ytterligare 5000 människoliv är det ändå det mindre dystra av alternativen.

Jag väntade länge med att skriva detta för att se om det kom några nya rapporter idag, i frånvaro av det hoppas jag att det vi såg igår bara var en naturlig variation.

Värt att notera är att det produceras respiratorer i landet vilket förhoppningsvis leder till att antal intensivvårdsplatser kan ökas. Frågan är bara hur snabbt vårdplatserna kan öka.

//Johan

Prognosen är klar

Posted: 2020-03-15 20:34:42

Efter fler dagars arbete med att ta fram och kalibrera en modell har jag fått fram ett resultat. Siffrorna skrämmer mig lite. Det verkar nämligen som att om vi inte vidtar otroligt strikta ändringar på samhällsnivå så kommer hela befolkningen ha blivit infekterad innan sommaren.

Sidan med "colormaps" är fortfarande ostadig och kanske kommer att göras om ordentligt.

Animeringen över spridningsförloppet tycker jag personligen är rätt intressant, men den tappar lite mening när vi inte längre testar.

Det är NU vi har chansen att begränsa spridningen och skadorna. Vi måste agera snabbt och ordentligt för att rädda så många människoliv som möjligt!

//Johan